eformations BioInfo Genotoul / Sigenae

La Formation Permanente Nationale d’INRAE, l’équipe SIGENAE et la plateforme BioInfo Genotoul mettent à disposition deux formations en bioinformatique depuis la plateforme de e-formation  https://elearning.formation-permanente.inra.fr/ :

  • FastQC : outil de contrôle et d’interprétation de la qualité des séquences
  • Galaxy : initiation et spécificité de l’instance Sigenae

La plateforme est accessible à l’ensemble des agents INRAE (connexion LDAP).

Il est également possible d’ouvrir ponctuellement ces formations aux extérieurs sur simple demande (https://cvip.sphinxonline.net/v4/s/eu9r3t).

Ces formations sont disponibles depuis la page accueil de la plateforme en cliquant sur la rubrique “Sciences” (puis rubrique « Bioinformatique ») :

La e-formation à l’utilisation de l’outil FastQC vous permettra de comprendre et commenter les graphiques statistiques obtenus et plus particulièrement :

  • d’identifier d’éventuels artefacts et/ou problèmes rencontrés lors de l’analyse de la qualité de vos séquences,
  • de comprendre la composition en nucléotides de vos séquences,
  • de comprendre la surreprésentation de séquences,
  • d’expliquer la présence d’adaptateurs, et/ou de problèmes techniques liés au séquençage.

La e-formation Galaxy vous permettra de découvrir les principales fonctionnalités de la plateforme web Galaxy ainsi que les outils et thématiques disponibles dans l’instance Sigenae/BioInfo Genotoul.

Estimation pour un suivi intégral de chaque formation : 1 jour.


Prenez soin de vous et de vos proches.