(Mail du 05\/07\/2023)<\/p>\n
Chers utilisateurs,<\/p>\n
Ce message a pour objectif de vous informer des cons\u00e9quences du renouvellement de l\u2019infrastructure de calcul Genotoul-Bioinfo.<\/p>\n
Nous souhaitons conclure la migration du cluster \u00ab genologin \u00bb vers le nouveau cluster \u00ab genobioinfo \u00bb fin d\u00e9cembre 2023.<\/strong><\/p>\n Nous avons pr\u00e9sent\u00e9 les changements et la nouvelle infrastructure lors d\u2019un s\u00e9minaire d\u00e9di\u00e9.<\/p>\n Vous trouverez la pr\u00e9sentation qui contient de nombreuses informations utiles sur ce lien : http:\/\/genoweb.toulouse.inra.fr\/~formation\/cluster\/doc\/SEMINAIRE_MIAT_2023.pdf<\/p>\n Toutes vos donn\u00e9es et vos travaux devront \u00eatre transf\u00e9r\u00e9s et si besoin adapt\u00e9s d\u2019ici la fermeture.<\/strong><\/p>\n Vous trouverez ci-dessous quelques informations suppl\u00e9mentaires vous permettant cette migration :<\/p>\n Le nouveau cluster \u00ab genobioinfo \u00bb est accessible via la commande suivante :<\/p>\n ssh login_utilisateur@genobioinfo.toulouse.inrae.fr<\/strong><\/p>\n Transfert des donn\u00e9es<\/strong><\/span><\/p>\n Les donn\u00e9es qui sont dans le save ne doivent pas \u00eatre transf\u00e9r\u00e9es. Elles sont partag\u00e9es entre l\u2019ancienne et la nouvelle infrastructure.<\/p>\n Les donn\u00e9es qui sont dans le \/home et le \/work ne sont PAS r\u00e9cup\u00e9r\u00e9es.<\/p>\n Si vous souhaitez r\u00e9cup\u00e9rer les donn\u00e9es depuis votre espace disque personnel \/work\/username, alors vous pouvez utiliser la commande suivante (depuis le nouveau serveur genobioinfo ou via slurm : sbatch ou srun) :<\/p>\n rsync -avh \/oldwork\/username\/ \/work\/user\/username\/<\/strong><\/p>\n (voir diapo num\u00e9ro 46 du s\u00e9minaire)<\/p>\n Les donn\u00e9es qui sont dans les espaces projets (\/work\/project) seront transf\u00e9r\u00e9es par notre \u00e9quipe. Vous serez contact\u00e9\u00b7e pour cela au fur et \u00e0 mesure des renouvellements de contrats ou bien en fonction de vos demandes (extensions d\u2019espace disques, arriv\u00e9e d\u2019une nouvelle personne dans le projet, utilisation de nouveaux logiciels…)<\/p>\n Pour planifier la migration de vos machines virtuelles, veuillez nous contacter : support.bioinfo.genotoul@inrae.fr<\/p>\n Changements<\/strong><\/span><\/p>\n La nouvelle infrastructure diff\u00e8re de la pr\u00e9c\u00e9dente sur les points suivants :<\/p>\n \u00b7 L\u2019espace disque \/save\/username s\u2019appelle d\u00e9sormais \/save\/user\/username<\/p>\n \u00b7 L\u2019espace disque \/work\/username s\u2019appelle d\u00e9sormais \/work\/user\/username<\/p>\n \u00b7 Il n\u2019y a plus de partition smpq : tous les n\u0153uds de calcul sont \u00e0 grosse m\u00e9moire partag\u00e9e<\/p>\n \u00b7 modules : les noms des modules pr\u00e9c\u00e9dents ne sont pas repris, et diff\u00e8rent l\u00e9g\u00e8rement.<\/p>\n \u00b7 chemins vers les ex\u00e9cutables : l\u2019organisation des fichiers contenant les ex\u00e9cutables n\u2019est pas la m\u00eame.<\/p>\n \u00b7 logiciels : tous les logiciels ne sont pas r\u00e9install\u00e9s sur le nouveau cluster \u00ab genobioinfo \u00bb ?<\/p>\n \nPour faire une demande d\u2019installation : https:\/\/bioinfo.genotoul.fr\/index.php\/ask-for\/install-soft\/ (cf \u00e0 partir de la diapo 30 du s\u00e9minaire)<\/p>\n A partir de mi-septembre 2023, plus aucun logiciel ne sera install\u00e9 sur l\u2019ancien cluster \u00ab genologin \u00bb.<\/strong><\/p>\n D\u00e8s \u00e0 pr\u00e9sent, les installations sur le nouveau cluster sont prioritaires.<\/p>\n Les vacances entra\u00eenant un support r\u00e9duit durant cet \u00e9t\u00e9, nous vous invitons \u00e0 faire vos demandes d\u2019installation au plus t\u00f4t.<\/p>\n A partir de mi-septembre, les quotas d\u2019heures de calcul ne seront plus augment\u00e9s sur l\u2019ancien cluster \u00ab genologin \u00bb.<\/p>\n Des dispositions particuli\u00e8res pourront \u00eatre discut\u00e9es pour les projets dans l\u2019impossibilit\u00e9 de migrer \u00e0 cette date.<\/p>\n Nous sommes, comme toujours, \u00e0 votre disposition si vous avez des questions ou des difficult\u00e9s \u00e0 utiliser la nouvelle infrastructure (support.bioinfo.genotoul@inrae.fr).<\/p>\n Bien cordialement,<\/p>\n L\u2019\u00e9quipe de la plateforme GenoToul-Bioinfo.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" (Mail du 05\/07\/2023) Migration sur le nouveau cluster et dates limites Chers utilisateurs, Ce message a pour objectif de vous informer des cons\u00e9quences du renouvellement de l\u2019infrastructure de calcul Genotoul-Bioinfo. Nous souhaitons conclure la...<\/p>\n","protected":false},"author":5,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":[],"yoast_head":"\n